COVID-19パンデミックの震源地における市場の野生生物とウイルスの遺伝子追跡

新型コロナウイルスの起源、中国武漢市のタヌキか　米誌
以下は、記事の抜粋です。

Cell誌に掲載された論文は、パンデミックを引き起こした新型コロナウイルスの起源は中国武漢市の卸売市場にいたタヌキだった可能性が高いと報告した。

スクリプス研究所やアリゾナ大学などの研究グループは、メタゲノム解析という手法を使い、2020年1月に華南海鮮卸売市場の壁や床などから拭い取られた遺伝子情報を基に市場にいた動物を特定した。主にタヌキとシラガタケネズミ、イヌ、ヤブノウサギ、アムールハリネズミがいたという。

記事を読んでも良くわからないので、以下に論文の要約を抜粋します。

論文のタイトルは、”Genetic tracing of market wildlife and viruses at the epicenter of the COVID-19 pandemic（COVID-19パンデミックの震源地における市場の野生生物とウイルスの遺伝子追跡）です（論文をみる）。

動物の取引を通じて、世界中でウイルスの人獣共通感染が発生しています。COVID-19パンデミックの始まりは、疫学的に華南海鮮卸売市場にまで遡る。2020年初頭に華南市場のいろいろな場所で収集されたPCRとシーケンスデータを分析した。

市場内で採取された重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）の遺伝的多様性はパンデミックの多様性と一致しており、野生動物の店の近くと内部でSARS-CoV-2陽性が増加していることを実証した。店のすべてのSARS-CoV-2陽性サンプルで野生動物のDNAを特定した結果、以前に中間宿主の可能性があると特定されたジャコウネコ、タケネズミ、タヌキなどの種を含んでいた。

また、タヌキ、ジャコウネコ、タケネズミに感染する動物ウイルスも検出した。メタゲノムアプローチと系統学的アプローチを組み合わせて、市場の動物の遺伝子型を復元し、農場や他の市場の動物と比較した。この分析は、血清学的およびウイルスのサンプリングの優先順位を決めるための、SARS-CoV-2 の潜在的な中間宿主の候補リストの遺伝的根拠を提供します。

私が論文を読んだ限りでは、タヌキに決まったわけではなく、ジャコウネコやタケネズミという動物の可能性もあると思います。いずれにしても、華南海鮮卸売市場の動物から感染が広まったことは間違いなさそうです。